การอักเสบในร่างกายมนุษย์ เกิดขึ้นได้กับอวัยวะต่างๆ มีผลให้อวัยวะนั้นเป็นอันตราย และสูญเสียการทำงานที่ปกติไป กรดไขมันโอเมก้า-3 มี 2 ชนิด คือ EPA ซึ่งมีความสำคัญในการระงับอาการอักเสบ และให้ผลดีต่อหัวใจ และหลอดเลือด และ DHA ซึ่งให้ผลดีต่อสมอง และจอตา

EPA จะผลิตสารคล้ายฮอร์โมนสำคัญที่เรียก ไอโคซานอยด์ ซึ่งมีผลระงับการอักเสบในขณะที่ DHA จะไม่ผลิตสารไอโคซานอยด์ แต่จะทำหน้าที่เป็นเหมือนโครงสร้าง ที่มีประโยชน์ต่อเยื่อหุ้มเซลล์สำคัญที่สมองและจอตา นักวิทยาศาสตร์พบว่า DHA สามารถเปลี่ยนเป็น EPA ได้ในร่างกายยามจำเป็น แต่ EPA จะไม่เปลี่ยนเป็น DHA

ในธรรมชาติ กรดไขมันทั้ง 2 ชนิด จะพบร่วมกัน และทำงานคล้ายคลึงกัน โดยทั้ง 2 ชนิด มีคุณสมบัติในการลดระดับโคเลสเตอรอล และไตรกลีเซอร์ไรด์ในเลือด และแต่ละชนิด ก็ยังมีคุณสมบัติเฉพาะของตัวเอง โดยที่ EPA ให้ผลระงับขบวนการอักเสบ ทั้งแบบเรื้อรัง และเฉียบพลันมีผลให้ลดความเจ็บปวดที่เกิดจากอาการอักเสบอย่างเช่น ข้ออักเสบ ทั้งในผู้ป่วยข้อเสื่อม และผู้ป่วยโรคแพ้ภูมิตัวเอง อย่างเช่น เอสแอลอี (SLE) หรือข้ออักเสบรูมาตอยด์

การบริโภคโอเมก้า-3 ทำให้ผู้ป่วยข้ออักเสบรูมาตอยด์มีอาการดีขึ้น โดยที่อาการบวมลดลงเจ็บปวดน้อยลง อาการข้อติดขัดในยามเช้าลดลง การเคลื่อนไหวข้อดีขึ้น และข้อมีแรงมากขึ้น ปริมาณการบริโภค ประมาณ 3 กรัม/วัน ติดต่อกัน อย่างน้อย 3 เดือน

นอกจากคุณสมบัติการต้านอาการอักเสบที่โดดเด่นของ EPA แล้ว เมื่อปริมาณ EPA ในสมองลดลง ศูนย์หิวของมนุษย์จะถูกกระตุ้น การที่มีปริมาณ EPA ในสมองเพียงพอ จะทำให้เราไม่รู้สึกหิว ซึ่งเป็นความหวังใหม่ในการควบคุมน้ำหนักอีกด้วย

EPA เป็นส่วนสำคัญในเซลล์ทุกเซลล์ของเราหากขาด EPA เซลล์ของเราจะไม่สามารถสื่อสารกันได้นักวิทยาศาสตร์พบว่า EPA ช่วยต้านอาการซึมเศร้า และโรคอารมณ์ปรวนแปรไม่คงที่

อาการที่เหมาะกับการใช้น้ำมันปลาในสูตรที่มี EPA สูง

- ข้ออักเสบ และข้ออักเสบรูมาตอยด์

- อาการเจ็บปวด หรือเมื่อยกล้ามเนื้อ และอ่อนล้าเรื้อรัง (ME/CFS)

- ผื่นแพ้ผิวหนัง สิว สะเก็ดเงิน (เรื้อนกวาง)

- ภาวะสมาธิสั้น (ADHA) และการอ่านหนังสือไม่ออก (Dyslexia)

- ภาวะซึมเศร้า (Depression) และอารมณ์ปรวนแปรสุดขั้ว (Bipolar Disorder)

- โรคจิตเภท